MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ECT-R 2 plasmid pLUH01

Total Repeats: 51

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017346	GAA	2	6	34	39	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017346	TTA	2	6	232	237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017346	ATTT	2	8	239	246	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017346	ATT	2	6	261	266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017346	GTT	2	6	276	281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017346	A	6	6	351	356	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017346	ATT	2	6	378	383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017346	TAT	2	6	464	469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017346	TAAA	2	8	470	477	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017346	TATTT	2	10	510	519	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017346	T	6	6	536	541	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017346	TCT	2	6	634	639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017346	TA	3	6	651	656	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017346	TTG	2	6	722	727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017346	A	7	7	745	751	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017346	AGT	2	6	756	761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017346	ACT	2	6	789	794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017346	ATA	2	6	816	821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384863395
19	NC_017346	CTA	2	6	822	827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384863395
20	NC_017346	AAC	2	6	885	890	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384863395
21	NC_017346	GA	3	6	898	903	50 %	0 %	50 %	0 %	384863395
22	NC_017346	AGA	2	6	906	911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384863395
23	NC_017346	TAAAAA	2	12	948	959	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384863395
24	NC_017346	TGA	2	6	1009	1014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384863395
25	NC_017346	GAA	2	6	1121	1126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384863395
26	NC_017346	GTT	2	6	1127	1132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384863395
27	NC_017346	A	6	6	1256	1261	100 %	0 %	0 %	0 %	384863395
28	NC_017346	TTG	2	6	1275	1280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384863395
29	NC_017346	TAA	2	6	1309	1314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384863395
30	NC_017346	ATG	2	6	1317	1322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384863395
31	NC_017346	TAT	2	6	1350	1355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384863395
32	NC_017346	TA	3	6	1391	1396	50 %	50 %	0 %	0 %	384863395
33	NC_017346	AAG	2	6	1401	1406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384863395
34	NC_017346	AGC	2	6	1507	1512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384863395
35	NC_017346	T	6	6	1552	1557	0 %	100 %	0 %	0 %	384863395
36	NC_017346	TGA	4	12	1561	1572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384863395
37	NC_017346	TGG	2	6	1636	1641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384863395
38	NC_017346	GAT	2	6	1676	1681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384863395
39	NC_017346	ACA	2	6	1724	1729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384863395
40	NC_017346	GAA	3	9	1733	1741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384863395
41	NC_017346	ATT	3	9	1785	1793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384863395
42	NC_017346	T	7	7	1828	1834	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017346	A	6	6	1932	1937	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017346	A	6	6	1953	1958	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017346	TTTG	2	8	1983	1990	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017346	AT	3	6	2001	2006	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017346	TA	3	6	2038	2043	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017346	ATAAAA	2	12	2118	2129	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017346	A	6	6	2185	2190	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017346	TAA	2	6	2198	2203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017346	TAT	2	6	2225	2230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.